Ferlið við frystiþurrku er aðallega skipt í tvö stig, annað er frystingarstigið og hitt er lofttæmisstigið (einnig kallað þurrkunar- eða sublimation stig). Margir halda að því lægra sem frosthiti og lofttæmi er í þurrkunarstigi, því betra þegar frostþurrkari er notaður, en svo er ekki.
Eiginleikar hvers efnis eru mismunandi, þannig að kristöllunarpunktar þeirra eru mismunandi. Frosthitastig og vatnstökuhitastig í frystistigi frystiþurrkunnar eru aðallega ákvörðuð í samræmi við eiginleika efnisins sjálfs, ekki því lægra því betra og hitastigið er of lágt. Sóa orku, og í öðru lagi lengja tíma efna í frystiþurrku.
Þurrkunarstiginu má skipta frekar í forþurrkun, aðalþurrkun og aukaþurrkun. Notkun hvers stigs og hversu mikil þurrkun sem hægt er að ná fer fyrst og fremst eftir þurrkunarferlinu.
Forþurrkun frystiþurrkarans vísar til fyrsta stigs þurrkunar sem fjarlægir aðallega frjálsan raka; Aðalþurrkun frystiþurrkunnar vísar til þurrkunarstigsins sem fjarlægir aðallega frjálsan raka og fyrsta þurrkunin er aðeins hægt að framkvæma í lofttæmi; önnur þurrkun á frostþurrkara Vísar til þurrkunarstigsins frá frostþurrkun til að fullkominn fjarlæging á raka sem er í föstu fjölliða ástandinu.
